Актуальные вопросы создания и применения банков ДНК для целей криминалистики и смежных дисциплин

Review article presents essential information on DNA databases, forensic genomics for human identification and suspect characteristics. Author reports the essential information on the topic of forensic DNA databases and data processing. DNA databases are important tools for the improvement of performance of the security organizations and services with a final goal of national security enhancement.В статье-обзоре литературы приводятся основные сведения, касающиеся функционирования, разработки, развития и внедрения технических, лабораторных и кибернетических средств анализа и обработки геномных данных, предназначенных для улучшения результатов работы ряда криминалистических и судебно-медицинских служб, что имеет весомое значение для обеспечения безопасности граждан СНГ

ПРОГНОЗИРОВАНИЕ РЕЦИДИВА РАКА ЯИЧНИКОВ НА ОСНОВЕ КОМПЬЮТЕР-АССИСТИРОВАННОГО МОРФОМЕТРИЧЕСКОГО ИССЛЕДОВАНИЯ

An experience in lymphangiogenesis morphometry applying their original software is described. For the implementation in clinical practice protocols, it is necessary to carry out a large-scale studies, where the objects of research are in the earliest stages of pathology.Разработана методика морфометрического исследования на основе обработки изображений с помощью оригинально сконструированного программного обеспечения. Для обоснования внедрения таких методов в клиническую практику необходимо выполнить широкомасштабные исследования, где объектами изучения будут опухоли на ранних стадиях развития

Программное обеспечение и возможности современных языков программирования для изучения биоинформатики и вычислительной вакцинологии новой коронавирусной инфекции

The review paper focuses on the application of software for the purposes of genomics, immunoinformatics, computational vaccinology, mathematical epidemiology and phylogeny of the new coronavirus infection. Authors provide a classification of software for the investigation of COVID-19.Обзорная статья сосредоточена на вопросах применения программного обеспечения для целей геномики, иммуноинформатики, вычислительной вакцинологии, математической эпидемиологии и филогенеза новой коронавирусной инфекции. Приводится разработанная авторами классификация программного обеспечения для изучения COVID-19

Cовременные алгоритмы обработки данных транскриптомов: обзор методов и результаты апробации

Analysis of bioinformatics data is an actual problem in modern computational biology and applied mathematics. With the development of biotechnology, as well as tools for obtaining and processing information derived from biological objects and systems, unresolved issues of the development and application of new algorithms and software have emerged. The authors propose practical algorithms and methods for processing transcriptome data for effective results of annotation, visualization and interpretation of data. Анализ биоинформатических данных является актуальной проблемой современной вычислительной биологии и прикладной математики. С развитием биотехнологий, а также инструментальных средств получения и обработки информации о биологических объектах и системах, появились нерешенные вопросы разработки и применения новых алгоритмов и программного обеспечения. Авторы предлагают практические алгоритмы и методы обработки транскриптомных данных для эффективных результатов аннотирования, визуализации и интерпретации биоинформатических данных

Cовременные алгоритмы обработки данных транскриптомов: обзор методов и результаты апробации

Analysis of bioinformatics data is an actual problem in modern computational biology and applied mathematics. With the development of biotechnology and tools for obtaining and processing such information, unresolved issues of the development and application of new algorithms and software have emerged.Authors propose practical algorithms and methods for processing transcriptomic data for efficient results of annotation, visualization and interpretation of bioinformatics data.Анализ биоинформатических данных является актуальной проблемой современной вычислительной биологии и прикладной математики. С развитием биотехнологий и инструментальных средств получения и обработки данной информации появились нерешенные вопросы разработки и применения новых алгоритмов и программного обеспечения.Авторы предлагают практические алгоритмы и методы обработки транскриптомных данных для эффективных результатов аннотирования, визуализации и интерпретации биоинформатических данных

НОВЫЕ МОРФОМЕТРИЧЕСКИЕ АЛГОРИТМЫ ОБРАБОТКИ ИЗОБРАЖЕНИЙ ЛИМФАНГИОГЕНЕЗА

Authors describe in technical details a set of algorithms, developed and implemented for the goals of lymphangiogenesis and angiogenesis image processing with application for the comprehensive quantitative description, correlative statistics and tumoral expansion prognosis.Приводится подробное техническое описание морфометрических алгоритмов для анализа патоморфологических изображений лимфангиогенеза и ангиогенеза

ПРОГРАММНО-ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫЙ КОМПЛЕКС «ОКУНЬ-2» ДЛЯ ОЦЕНКИ МУТАЦИОННОГО ПРОФИЛЯ ГЕНОВ РЕЗИСТЕНТНОСТИ И ВИРУЛЕНТНОСТИ СЕКВЕНИРОВАННЫХ ГЕНОМОВ МИКОБАКТЕРИИ ТУБЕРКУЛЕЗА

Authors describe a new software and computer complex designed and developed for the processing of the data of the whole genomes of mycobacterium tuberculosis with the purpose of obtaining information about the profile of tuberculosis resistance and virulence.Приводится описание нового программно-вычислительного комплекса, предназначенного для обработки данных полных геномов микобактерии туберкулеза человека с целью получения информации о профиле резистентности и вирулентности туберкулеза

Enhancement of the Electron Spin Resonance of Single-Walled Carbon Nanotubes by Oxygen Removal

We have observed a nearly fourfold increase in the electron spin resonance (ESR) signal from an ensemble of single-walled carbon nanotubes (SWCNTs) due to oxygen desorption. By performing temperature-dependent ESR spectroscopy both before and after thermal annealing, we found that the ESR in SWCNTs can be reversibly altered via the molecular oxygen content in the samples. Independent of the presence of adsorbed oxygen, a Curie-law (spin susceptibility $\propto 1/T$) is seen from $\sim$4 K to 300 K, indicating that the probed spins are finite-level species. For both the pre-annealed and post-annealed sample conditions, the ESR linewidth decreased as the temperature was increased, a phenomenon we identify as motional narrowing. From the temperature dependence of the linewidth, we extracted an estimate of the intertube hopping frequency; for both sample conditions, we found this hopping frequency to be $\sim$100 GHz. Since the spin hopping frequency changes only slightly when oxygen is desorbed, we conclude that only the spin susceptibility, not spin transport, is affected by the presence of physisorbed molecular oxygen in SWCNT ensembles. Surprisingly, no linewidth change is observed when the amount of oxygen in the SWCNT sample is altered, contrary to other carbonaceous systems and certain 1D conducting polymers. We hypothesize that physisorbed molecular oxygen acts as an acceptor ($p$-type), compensating the donor-like ($n$-type) defects that are responsible for the ESR signal in bulk SWCNTs.Comment: 14 pages, 7 figure

Oбзор существующих зарубежных подходов к определению и оценке инновационности лекарственных препаратов

A set of criteria for assessing the innovative potential of drugs (therapeutic value) have been developed and are widely used elsewhere. These approaches allow the state (the payer) to assess the clinical significance of a new medical product and make an educated decision on the reimbursement, cost and priority at the stage of registration. In the Russian Federation though, such criteria and methods are not sufficiently developed. This review describes the principle approaches to assessing the drug innovative potential in countries outside Russia. В зарубежных странах разработаны и широко используются критерии оценки степени инновационности лекарственных препаратов (ЛП) (терапевтической ценности), которые позволяют государству, как плательщику, оценить клиническую значимость нового ЛП и принять обоснованное решение о его возмещении, определении его стоимости и приоритетности на стадии регистрации. В настоящее время в РФ не разработаны в достаточной степени критерии и методология проведения данной оценки. В статье описаны основные методологические подходы к оценке инновационности ЛП в зарубежных странах.

PROGNOSIS OF THE RELAPSE OF OVARIAN CANCER BASED ON THE COMPUTER-ASSISTED MORPHOMETRIC STUDY OF OVARIAN CARCINOMA SAMPLES STAINED WITH VARIOUS HISTOCHEMICAL MARKERS

An experience in lymphangiogenesis morphometry applying their original software is described. For the implementation in clinical practice protocols, it is necessary to carry out a large-scale studies, where the objects of research are in the earliest stages of pathology